倭寇一直是大明王朝的心腹大患，尤其嘉靖年間，倭寇猖獗至極，沿海多地遭受侵擾，戚家軍也因此橫空出世，但令人好奇的是，困擾明朝200多年的倭寇之亂，到了清朝竟悄然消失，事實上背後得益於3大關鍵因素，包括明朝的強力打擊、日本嚴厲的海禁政策，以及清朝透過倉儲系統，解決沿海百姓的糧食供應問題。
14世紀，日本進入南北朝分裂時期，戰敗的南方封建勢力為了謀生，組織武士與浪人，對大陸沿海進行武裝走私與掠奪，因而被稱為「倭寇」，倭寇之亂讓明朝歷代皇帝十分頭痛，這股勢力之所以到了清朝就銷聲匿跡，主要有3大原因。
首先是明朝中後期對倭寇的強力打擊。嘉靖年間，朝廷先後啟用戚繼光、俞大猷等名將，展開大規模剿寇行動。戚家軍在浙江、福建屢戰屢勝，後來又聯手平定廣東的倭寇勢力，基本掃平整個東南沿海，之後的隆慶年間，朝廷放寬海禁，允許民間進行海外貿易，改善沿海民生，減少了百姓與倭寇勾結的誘因。
其次是日本自身的政策變化。德川家康建立幕府後，為防止西方勢力與本國百姓勾連，影響自己在日本的統治，所以頒布了「鎖國令」，嚴禁對外交流。這使得武士、浪人出海的可能性大幅減少，也削弱了倭寇的根源。
第三是清朝對民生的改善。清政府建立更完善的倉儲系統，穩定糧食供應，使沿海百姓不再因飢餓鋌而走險，而少了內應，即使還有倭寇，也難以成氣候。同時，清朝也大力發展水師，加強對東南沿海地區的防禦，使外敵無法輕易侵擾。
